offrir aux musulmans un cadre adéquat d'expression de leur foi dans le respect et la tolérance ; servir de lieu de réflexion, d'expression et d'échange sur tout ce qui a trait à la foi religieuse de manière générale dans le respect et la tolérance ; promouvoir la solidarité entre ses membres ; favoriser le vivre ensemble avec les autres composantes de la population de la région Bourgogne-Franche-Comté ; contribuer à l'organisation des activités cultuelles et éducatives dans l'amitié et le respect mutuel ; défendre les intérêts matériels et moraux de la communauté musulmane de la région Bourgogne-Franche-Comté ; UMR Bourgogne-Franche-Comté est une union d'associations, régies par la loi du 1er juillet 1901, qui regroupe des associations gestionnaires de lieux de culte musulman dans la région Bourgogne-Franche-Comté ; elle est l'interlocutrice et la représentante unique dans la région Bourgogne-Franche-Comté de l'UMF (Union des mosquées de France)
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